科創(chuàng)新地標(biāo)|上海交大系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院：不再“單點”探究疾病

疾病是如何發(fā)生、發(fā)展的？為何同一疾病不同患者會有不同表現(xiàn)？疾病與基因之間有何關(guān)聯(lián)？科學(xué)家們在積極尋求答案的過程中越來越達成一個共識：對疾病的探究再也無法滿足“單點”認(rèn)識，要在復(fù)雜的人體、復(fù)雜的基因網(wǎng)絡(luò)中撥開云霧揭開迷津需要有更整體的系統(tǒng)思維。位于上海交通大學(xué)閔行校區(qū)的系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院帶著創(chuàng)新的使命，將生物、醫(yī)學(xué)、物理、工程、數(shù)學(xué)、信息、計算等不同學(xué)科結(jié)合，以系統(tǒng)生物學(xué)思想、策略和方法為攻克腫瘤、代謝性疾病、神經(jīng)變性疾病等多基因復(fù)雜性狀疾病發(fā)展新型診斷、治療和預(yù)防技術(shù)，近年已結(jié)出累累碩果，近3年發(fā)表SCI論文158篇，在惡性腫瘤、單細(xì)胞分析技術(shù)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多方面取得突破進展，代謝組學(xué)平臺達到國際一流水平。

東方哲學(xué)開啟醫(yī)學(xué)研究新篇

“2004年，陳竺院士在第53屆東方論壇首次提出了系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)新理念，希望將東方醫(yī)學(xué)中的整體觀與西方醫(yī)學(xué)思維結(jié)合，創(chuàng)新醫(yī)學(xué)研究?！毕到y(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院常務(wù)副院長、長江學(xué)者特聘教授韓澤廣說，“實際上當(dāng)時國外興起了將基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等知識運用于生物學(xué)研究的風(fēng)潮，但是對疾病的探究仍然習(xí)慣專注于某種疾病的本身。西方思維習(xí)慣從分子、原子等最小的結(jié)構(gòu)開始逐步探究生命，而東方的哲學(xué)思想則更注重整體觀和系統(tǒng)性，因此我們想到是否將兩者結(jié)合能夠摩擦出創(chuàng)新的火花？困擾當(dāng)下國人健康的慢病成為研究最先的切入點?！?/p>

由此，研究院直接從臨床醫(yī)學(xué)中的重大科學(xué)切入，把人體與環(huán)境作為一個完整體系，借鑒反向工程學(xué)原理，“自上而下”與“自下而上”相結(jié)合交叉融合多學(xué)科，整合應(yīng)用高通量組學(xué)技術(shù)以及建立疾病理論模型等現(xiàn)代生物學(xué)方法，以個性化診療和藥物創(chuàng)新為目標(biāo)，探索建立疾病發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸機理研究的全新理論體系和創(chuàng)新技術(shù)平臺。研究院已被列入教育部重點實驗室序列。

交叉學(xué)科合作結(jié)出累累碩果

通過十幾年探索，研究院的各課題組開始收獲成果。吳強教授團隊的一項研究揭示了三維DNA結(jié)構(gòu)是如何由一維DNA序列所“編碼”，闡明了DNA遺傳信息在三維基因結(jié)構(gòu)建立與形成中的重要作用，對從三維基因組角度認(rèn)識各種遺傳性疾病的根本病因及腫瘤發(fā)生發(fā)展機理具有重要意義，該研究于2015年發(fā)表在國際自然科學(xué)領(lǐng)域三大期刊之一的Cell（《細(xì)胞》）雜志上。

韓澤廣教授團隊關(guān)于“乙型肝炎病毒感染相關(guān)肝癌的功能基因組研究”獲得教育部高等學(xué)?？茖W(xué)研究優(yōu)秀成果獎自然科學(xué)一等獎。團隊對肝癌樣本的基因組進行了"地毯式搜捕"，找到了347個突變基因，已證明其中3個在肝癌發(fā)病與轉(zhuǎn)移中起決定作用，這是世界上第一次利用新型大規(guī)模基因組分析技術(shù)研究肝癌轉(zhuǎn)移問題，為人類攻克肝癌提供新靶點，將為肝癌診斷、預(yù)后、治療及開發(fā)新型治療藥物奠定基礎(chǔ)。

“青年千人計劃”的施奇惠將通常用作化學(xué)分子觀察的微流控技術(shù)用于研究，利用腫瘤細(xì)胞的化學(xué)特性識別血液中的腫瘤細(xì)胞。此外，研究院開展白血病系統(tǒng)生物學(xué)研究的陳竺／陳賽娟課題組，聚焦系統(tǒng)生物學(xué)、進化理論的敖平課題組，著重基礎(chǔ)腫瘤研究的郭方課題組等18個課題組每年都有重大進展；集結(jié)多學(xué)科的公共平臺年服務(wù)量達142萬小時?！皬淖钤鐑H有幾個課題組到現(xiàn)在包括院士、國家千人、國家杰青、長江學(xué)者等高水平研究團隊，在多方支持下研究院的研究水平有明顯跨越，應(yīng)該說這條東西方思維結(jié)合的科學(xué)道路越來越清晰明朗。”韓澤廣說。

蝴蝶形的研究院大樓里，基因組等“組學(xué)”平臺、信息整合與分析平臺、細(xì)胞和動物疾病模型平臺分布在ABCD4個區(qū)域的不同樓層，為白血病和腫瘤、代謝性（糖尿?。窠?jīng)變性疾病（老年癡呆）和中醫(yī)藥治療機制尋找新型分子標(biāo)志物、干預(yù)靶標(biāo)和潛在治療手段。大樓中央的旋轉(zhuǎn)樓梯和走廊連接各方，巨大的大廳放滿小桌椅，不同學(xué)科背景和研究領(lǐng)域的研究者常常在這里互通有無，碰撞靈感。

備注：數(shù)據(jù)僅供參考，不作為投資依據(jù)。